Een belangrijke functionaliteit in de ELO is het uitdelen en inleveren van opdrachten. Elke ELO-opdracht kan gekoppeld worden aan een cijferkolom in de cijferstructuur, zodat de cijfers ook direct in de schooladministratie worden geregistreerd. Bovendien kan plagiaatcontrole worden toegepast op het ingeleverde werk. Leerlingen worden in hun agenda attent gemaakt op een ELO-opdracht, waar ook het overige huiswerk digitaal getoond wordt. Zo is er bij leerlingen, maar ook bij mentoren en ouders, altijd duidelijkheid over wat er gedaan moet worden. Wanneer de opdracht is afgerond, kan deze via de ELO worden ingeleverd. Hierbij kan tevens plagiaatcontrole uitgevoerd worden.

Bij het inleveren van de opdracht wordt het werk dan vergeleken met teksten op het internet en met eerder ingeleverde opdrachten. Als leerlingen eenmaal weten dat hun werk op deze manier serieus onder de loep genomen wordt, vergroot dat hun inzet aanzienlijk. De docent kan een ingeleverde opdracht bekijken en beoordelen. Hij heeft altijd overzicht over welke leerlingen uit een klas de opdracht zijn gestart, wie de opdracht al hebben ingeleverd en hoeveel er nog beoordeeld moeten worden. Het ontvangen van persoonlijke feedback neemt een belangrijke plaats in tijdens het leerproces. Daarom kan een docent een opmerking bij een beoordeling plaatsen om het cijfer nader toe te lichten. Zonodig kan de leerling de opdracht op basis van de feedback aanpassen en dan nogmaals inleveren.

De gehele workflow van een opdracht wordt duidelijk in beeld gebracht in het Vandaagscherm en in de diverse opdrachtoverzichten. Zo ontvangt een leerling bij het opstarten van Magister in zijn Vandaagscherm een mededeling dat er een openstaande ELO-opdracht is. Hij is hiervan dus altijd op de hoogte. Deze manier van communiceren geeft zowel de leerling als de docent een goed overzicht.